项目申报子系统用于管理生态环境专项资金项目的申报过程。该子系统提供了在线填写项目申报表、上传相关附件和资料、审核流程等功能，方便各地区单位和个人进行项目申报。

项目执行子系统用于管理项目的具体执行过程。该子系统提供了项目进度管理、资金拨付管理、监督检查等功能，以确保项目按照计划顺利进行，并实现预期的环境效益。

绩效评估子系统用于评估项目的绩效和效益。该子系统提供了绩效指标设定、数据采集、绩效评估报告生成等功能，以便于对项目的效果进行评估和总结，为后续的决策提供参考。